Standardowe testy dla koronawirusa 2 zespołu ostrej ostrej niewydolności oddechowej (SARS-CoV-2) wykrywają obecność wirusowego RNA za pomocą PCR w czasie rzeczywistym z odwrotną transkrypcją (rRT). Ostatnio opracowano wygodne, szybkie i stosunkowo niedrogie metody wykrywania antygenu SARS-CoV-2 (Ag). Test STANDARD Q COVID-19 Ag (SD Biosensor, Inc., Suwon, Korea) to szybki test immunochromatograficzny, który jakościowo wykrywa białko nukleokapsydu SARS-CoV-2 przy użyciu przeciwciał sprzężonych ze złotem. Oceniliśmy jego działanie w porównaniu z testem Allplex 2019-nCoV (Seegene, Seul, Korea) w retrospektywnym badaniu kliniczno-kontrolnym z wykorzystaniem próbek resztkowych.
Czułość i swoistość testu STANDARD Q COVID-19 Ag wyniosła odpowiednio 89,2% (58/65) i 96,0% (96/100). Wartości progowe cyklu (Ct) dla trzech docelowych genów SARS-CoV-2 (otoczki, zależnej od RNA polimerazy RNA i genów nukleokapsydowych) uwzględnionych w teście Allplex 2019-nCoV były znacznie niższe u pacjentów z dodatnim wynikiem testu Ag niż w teście Ag- pacjenci ujemni ( p <0,001). Czułość testu Ag była wyższa w próbkach z Ct≤30 i pobranych od jednego do pięciu dni po wystąpieniu objawów. Podsumowując, test STANDARD Q COVID-19 Ag może służyć jako alternatywa w warunkach wysokiego rozpowszechnienia, gdy niska czułość jest kompensowana lub gdy testy rRT-PCR są ograniczone.
Oceniliśmy dokładność diagnostyczną dwóch nowo opracowanych, przyłóżkowych, szybkich testów antygenowych (RAT) do wykrywania SARS-CoV-2, AFIAS COVID-19 Ag i ichromaTM COVID-19 Ag oraz zbadaliśmy kinetykę antygenu.
Przeanalizowano łącznie 200 seryjnie pobranych próbek z nosogardła (NP) od 38 pacjentów z COVID-19 i 122 próbki z kontroli negatywnych. Czułość i swoistość diagnostyczną oceniono w porównaniu z wynikami testów molekularnych i podzielono według docelowych genów (E, RdRP i N) oraz dni po wystąpieniu objawów (PSO).
- Do oceny kinetyki zastosowano wskaźniki odcięcia z seryjnych próbek NP zgodnie z liczbą dni PSO. Oba RAT wykazały czułość 91,3‒100% dla próbek z progiem cyklu (Ct) <25. Swoistość AFIAS wynosiła 98,7‒98,9%, a ichromaTM 100,0%. Wartości kappa AFIAS i ichromaTM do badań molekularnych próbek o Ct < 25 (RdRP) wyniosły odpowiednio 0,97 i 1,00.
- Czułość AFIAS i ichromaTM dla wszystkich genów była niższa dla próbek pobranych przy 8-14 PSO niż dla tych zebranych przed 7-dniowym PSO. Profile kinetyki wykazały, że poziomy antygenu stopniowo spadały z ≤7-dniowego PSO do >22-dniowego PSO. Oba RAT wykazały doskonałą swoistość i akceptowalną czułość w przypadku próbek NP o wyższym mianowaniu wirusa oraz próbek pobranych w ciągu 7 dni od PSO.
- W związku z tym mogą stać się użytecznymi narzędziami do wczesnego wykrywania SARS-CoV-2. Jednak ze względu na obawy dotyczące fałszywie ujemnego wyniku RAT należy stosować w połączeniu z testami molekularnymi.
- Ultraczuły szybki test diagnostyczny Alere Plasmodium falciparum Malaria Ag bogaty w histydynę 2 (Alere uRDT) to nowe narzędzie diagnostyczne, które jest droższe niż inne szybkie testy diagnostyczne malarii (RDT) stosowane rutynowo w klinikach w Ugandzie.
- Producent zaleca testowanie próbek w ciągu 2 dni i ocenianie wyników po 20 minutach, co może być niepraktyczne w klinikach o dużej objętości i ubogich w zasoby. Porównaliśmy testy za pomocą szybkiego testu diagnostycznego Alere Ag (uRDT), CareStart RDT, mikroskopii i ultraczułej ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkrypcją I8S rRNA (qRT-PCR) przy użyciu próbek ankietowych i klinicznych. W przypadku Alere uRDT wykorzystaliśmy ankietowe próbki krwi przechowywane w temperaturze 4°C przez 44 dni, a niektóre próbki kliniczne celowo zmierzyliśmy wyniki powyżej 20 minut.
- Testy Alere uRDT i qRT-PCR zidentyfikowały bezobjawowe przypadki parazytemii odpowiednio w 56% i 72% próbek ankietowych, które zostały pierwotnie ocenione jako ujemne przez CareStart RDT. Stosując qRT-PCR jako złoty standard, Alere uRDT przewyższał CareStart RDT w szacowaniu bezobjawowej częstości występowania pasożytów w badaniu przekrojowym ( p = 0,007) oraz w wykrywaniu klinicznie istotnej malarii; obie RDT były porównywalne w wykrywaniu bezobjawowej parazytemii w klinice ( p = 0,599). Punktacja wyników Alere uRDT po 20 minutach dała ważne wyniki potwierdzone przez CareStart RDT, ale istniało spójne tło; ocena Alere uRDT powyżej 20 minut dała wyniki fałszywie dodatnie.
- Alere uRDT przewyższał CareStart RDT w badaniu terenowym w szacowaniu częstości występowania malarii oraz w klinice objawowej choroby malarii. Dało wiarygodne wyniki przy użyciu próbek przechowywanych w temperaturze 4°C przez 44 dni, ale wyniki testu odczytane dłużej niż 20 minut były nieważne.
W placówkach o ograniczonych zasobach lub w placówkach opieki, szybkie testy diagnostyczne (RDT), które mają na celu jednoczesne wykrywanie przeciwciał HIV i antygenu kapsydu p24 (p24CA) z wysoką czułością, mogą stanowić ważną alternatywę dla badań przesiewowych pod kątem wczesnych infekcji.
Oceniliśmy działanie przeciwciał i składników antygenowych starej i nowej wersji RDTs Determine HIV-1/2 Ag/Ab Combo RDTs równolegle z oznaczeniami ilościowymi w teście immunologicznym antygen/przeciwciało czwartej generacji (4G-EIA), antygen p24CA test immunologiczny (p24CA-EIA), immunobloty i kwantyfikacja kwasów nukleinowych. Uwzględniliśmy próbki osocza ostrych, nieleczonych wcześniej zakażeń HIV-1 (stadia Fiebiga I-VI, podtypy A1, B, C, F, CRF02_AG, CRF02_AE, URF) lub przewlekłych zakażeń HIV-1 i HIV-2. Składnik antygenowy testu został również oceniony dla panelu wirusów HIV-1 przeniesionych/założycieli (T/F) podtypu B, szczepów HIV-2 i pierwotnych izolatów HIV-2.
Ponadto oceniliśmy czułość analityczną RDT w wykrywaniu p24CA przy użyciu wysoce oczyszczonego standardu p24CA HIV-1 NL4-3 . Odkryliśmy, że 77% próbek osocza pobranych od pacjentów z ostrym zakażeniem, immunoblot-ujemnych pacjentów z HIV-1 w stadiach II-III Fiebiga zostało zidentyfikowanych przez nowy RDT, podczas gdy tylko 25% uzyskało wynik pozytywny w starym RDT. Obydwa RDT reagowały na wszystkie próbki od pacjentów przewlekle zakażonych HIV-1 i ostro zakażonych HIV-1 z pozytywnym wynikiem immunoblottingu. Wszystkie próbki od przewlekle zakażonych pacjentów z HIV-2 uzyskały wynik dodatni w nowej RDT. Warto zauważyć, że czułość RDT w wykrywaniu zrekombinowanego p24CA z wirusa podtypu B wahała się między 50 a 200 pg/ml, odzwierciedlona również w wykrywaniu wirusów HIV-1 T/F tylko przy stężeniach antygenów dziesięciokrotnie wyższych niż sugerowane przez producenta . RTD nie rozpoznał żadnego z testowanych wirusów HIV-2.
Nasze wyniki wskazują, że nowa wersja Determine™ HIV-1/2 Ag/Ab Combo wykazuje zwiększoną czułość w wykrywaniu próbek osocza HIV-1 p24CA-dodatnich i immunoblot-ujemnych w porównaniu z wersją prekursorową. Czułość 4G-EIA i p24CA-EIA w wykrywaniu głównego strukturalnego antygenu HIV, a tym samym w diagnozowaniu ostrych infekcji przed serokonwersją, jest nadal wyższa.
Obecne szybkie testy diagnostyczne malarii (RDT) zawierają przeciwciała przeciwko bogatemu w histydynę białku 2 bogatemu w histydynę (PfHRP2) specyficznemu dla Plasmodium falciparum , dehydrogenazie mleczanowej Plasmodium (pLDH) i aldolazie w różnych kombinacjach.
Niskie lub wysokie gęstości pasożytów/docelowe stężenia antygenów mogą wpływać na dokładność i czułość RDT wykrywających PfHRP2. Przeanalizowaliśmy skuteczność SD Bioline Malaria Ag Pf/Pan RDT w odniesieniu do parazytemii P. falciparum na Madagaskarze, gdzie kliniczna malaria Plasmodium vivax występuje obok P. falciparum . Dziewięćset sześćdziesiąt trzy próbki od pacjentów szukających opieki z powodu podejrzenia zakażenia malarią przeanalizowano za pomocą RDT, mikroskopii i specyficznego dla gatunku Plasmodium testu z wykrywaniem ligazy i fluorescencyjnego testu mikrosferowego (LDR-FMA).
Dodatni wynik zakażenia Plasmodium w tej diagnostyce wyniósł odpowiednio 47,9%, 46,9% i 58%. Dominowały wyłącznie zakażenia Plasmodium falciparum (mikroskopia 45,7%; LDR-FMA 52,3%). W sumie 16,3% P. falciparum , 70% P. vivax i wszystkie zakażenia Plasmodium malarii , Plasmodium ovale i mieszanych gatunków były submikroskopowe. W 423 zakażeniach P. falciparum mono, potwierdzonych mikroskopowo i metodą LDR-FMA, parazytemia u osób z dodatnim wynikiem zarówno dla prążków PfHRP2 jak i pan-pLDH była znacznie wyższa niż u osób z dodatnim wynikiem tylko dla prążka PfHRP2 ( P < 0,0001). Plasmodium falciparum parazytemię u tych, które zostały wykryte jako P.
SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test Nasal |
|||
9901-NCOV-03G | Roche Diagnostics | 25 Tests/Kit | 94 EUR |
SARS-CoV-2 Antigen Rapid Test Kit |
|||
CoV2Ag-1 | UnScience | 1T | 8 EUR |
SARS-CoV-2 Antigen Rapid Test Kit |
|||
CoV2Ag-25 | UnScience | 25T/kit | 35 EUR |
Coronavirus (SARS-Cov-2) Antigen Rapid Test Device (Saliva) |
|||
IOV87952 | INVBIO | 20T/kit | 39 EUR |
Panbio™ COVID-19 Ag Rapid Test Device (Nasal) |
|||
41FK11 | Abbott | 25 Tests/Kit | 95 EUR |
Ag rapid CDV Ag Test Kit |
|||
RG11-03 | Bionote | 1 box | 138.2 EUR |
Ag Rapid AIV Ag Test Kit |
|||
RG15-01 | Bionote | 1 box/30 tests | 267 EUR |
Ag Rapid H5AIV Ag test kit |
|||
RG15-05 | Bionote | 1 box | 463 EUR |
Rapid PED Ag Test Kit |
|||
RG14-01 | Bionote | 1 box | 159.9 EUR |
Ag Rapid CIRD-3 Ag Test Kit |
|||
RG11-09 | Bionote | 1 box | 123.64 EUR |
Rapid TGE/PED Ag Test Kit |
|||
RG14-03 | Bionote | 1 box | 240.85 EUR |
Ag Rapid Bov. TB Ab Test Kit |
|||
RB23-02 | Bionote | 1 box | 145 EUR |
Ag Rapid FMD NSP Ab Test Kit |
|||
RB28-02 | Bionote | 1 box | 108.52 EUR |
Bionote Rapid AIV Ag_NDV Ag Test Kit |
|||
RG15-09 | Bionote | 1 box | 164.52 EUR |
Anigen Rapid FIV Ab/FeLV Ag Test Kit |
|||
RC12-04-DD | Bionote | 10 tests/Kit | 152.2 EUR |
Panbio™ COVID-19 Ag Rapid Test Device |
|||
41FK10 | Abbott | 25 Tests/Kit | 96 EUR |
Anti-SARS-CoV-2 Neutralization Antibody Test Kit (Colloidal gold immunoassay) |
|||
CP04010 | UnScience | 25T/kit | Ask for price |
SARS CoV-2 PCR kit |
|||
PCR-H731-48R | Bioingentech | 48T | 823 EUR |
SARS CoV-2 PCR kit |
|||
PCR-H731-96R | Bioingentech | 96T | 1113 EUR |
Anti-SARS-CoV-2 Antibody |
|||
A2061-50 | Biovision | 50 µg | 480 EUR |
SARS-CoV-2 Spike Peptide |
|||
9083P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 Spike Peptide |
|||
9087P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 Spike Peptide |
|||
9091P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 Spike Peptide |
|||
9095P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 Nucleocapsid Peptide |
|||
9099P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 Nucleocapsid Peptide |
|||
9103P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
Melamine Rapid Test Kit |
|||
abx092011-50tests | Abbexa | 50 tests | 370 EUR |
NDV rapid test kit |
|||
RG15-03 | Bionote | 1 box | 139.05 EUR |
IBD rapid test strip |
|||
RG15-04 | Bionote | 10 boxes | 148 EUR |
Rabies rapid test strip |
|||
RG18-01 | Bionote | 10 boxes | 151.92 EUR |
Anti-SARS-CoV-2 Neutralization Antibody Test Kit (Enzyme-linked immunosorbent assay) |
|||
CP04012 | UnScience | 96T/5*96T | Ask for price |
Accu-Tell COVID-19 IgG/IgM Rapid Test |
|||
GEN-B352-20tests | Accu test | 20 tests | 236 EUR |
Accu-Tell COVID-19 IgG/IgM Rapid Test |
|||
GEN-B352-40tests | Accu test | 40 tests | 321 EUR |
PreS2-Ag ELISA test |
|||
96 | Biobase | 96T/Box | Ask for price |
GENLISA™ SARS-CoV-2 (Covid-19) Surrogate Virus Neutralization Test (sVNT) ELISA |
|||
KBVH400 | Krishgen | 12 × 8 wells | 3185 EUR |
SARS-CoV-2 Antigen ELISA Kit |
|||
DEIA2020 | Creative Diagnostics | 96 tests | 905 EUR |
SARS CoV-2 RT PCR kit |
|||
RTq-H731-100R | Bioingentech | 100T | 1311 EUR |
SARS CoV-2 RT PCR kit |
|||
RTq-H731-150R | Bioingentech | 150T | 1787 EUR |
SARS CoV-2 RT PCR kit |
|||
RTq-H731-50R | Bioingentech | 50T | 963 EUR |
SARS-CoV-2 IgG ELISA Kit |
|||
E4901-100 | Biovision | 100 assays | 753 EUR |
Recombinant Coronavirus Nucleoprotein (SARS-CoV-2) |
|||
P1523-10 | Biovision | 10 µg | 156 EUR |
Recombinant Coronavirus Nucleoprotein (SARS-CoV-2) |
|||
P1523-50 | Biovision | 50 µg | 551 EUR |
SARS-CoV-2 Spike S2 Peptide |
|||
9119P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 Spike S2 Peptide |
|||
9123P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
Anti-CoV-2 & SARS-CoV S1 Antibody (Clone# CR3022) |
|||
A2103-200 | Biovision | 200 µg | 480 EUR |
SARS CoV E Protein |
|||
abx060650-1mg | Abbexa | 1 mg | 1692 EUR |
SARS CoV Nucleocapsid Protein |
|||
abx060652-1mg | Abbexa | 1 mg | 1873 EUR |
SARS-CoV Nucleocapsid Protein |
|||
abx060653-1mg | Abbexa | 1 mg | 1692 EUR |
SARS-CoV Nucleocapsid Protein |
|||
abx060654-1mg | Abbexa | 1 mg | 1692 EUR |
SARS-CoV Spike Protein |
|||
abx060655-1mg | Abbexa | 1 mg | 1692 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3219-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3219-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3221-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3221-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3223-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3223-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3225-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Spike Antibody |
|||
3225-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV Matrix Antibody |
|||
3527-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Matrix Antibody |
|||
3527-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV Matrix Antibody |
|||
3529-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Matrix Antibody |
|||
3529-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV Envelope Antibody |
|||
3533-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV Envelope Antibody |
|||
3533-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
Melamine (MEL) Rapid Test Kit |
|||
abx092057-50tests | Abbexa | 50 tests | 370 EUR |
Clenbuterol (CLE) Rapid Test Kit |
|||
abx092058-50tests | Abbexa | 50 tests | 244 EUR |
Ractopamine (RAC) Rapid Test Kit |
|||
abx092059-50tests | Abbexa | 50 tests | 244 EUR |
Salbutamol (SAL) Rapid Test Kit |
|||
abx092060-50tests | Abbexa | 50 tests | 244 EUR |
Tetracycline (TCs) Rapid Test Kit |
|||
abx092063-50tests | Abbexa | 50 tests | 398 EUR |
Sulfonamides (Sas) Rapid Test Kit |
|||
abx092064-40tests | Abbexa | 40 tests | 398 EUR |
Quinolones (QNs) Rapid Test Kit |
|||
abx092065-40tests | Abbexa | 40 tests | 398 EUR |
Ciprofloxacin (CPFX) Rapid Test Kit |
|||
abx092066-50tests | Abbexa | 50 tests | 398 EUR |
Quinolones (QNs) Rapid Test Kit |
|||
abx092067-40tests | Abbexa | 40 tests | 398 EUR |
Brucella Antibody Rapid Test Kit |
|||
abx092069-40tests | Abbexa | 40 tests | 356 EUR |
Procalcitonin rapid test (Colloidal Gold) |
|||
abx095264-80Units | Abbexa | 80 Units | 954 EUR |
Rapid Leishmania Ab Test Kit |
|||
RB2104 | Bionote | 1 box | 127 EUR |
HIV 1+2 Ag/Ab ELISA test |
|||
98 | Biobase | 96T/Box | Ask for price |
SARS CoV-2 One-Step PCR kit |
|||
Oneq-H731-100R | Bioingentech | 100T | 1610 EUR |
SARS CoV-2 One-Step PCR kit |
|||
Oneq-H731-150R | Bioingentech | 150T | 2205 EUR |
SARS CoV-2 One-Step PCR kit |
|||
Oneq-H731-50R | Bioingentech | 50T | 1175 EUR |
Anti-SARS-CoV-2 Antibody (Clone# 6F10) |
|||
A2060-50 | Biovision | 50 µg | 480 EUR |
Anti-SARS-CoV-2 Spike S1 Antibody |
|||
A3000-50 | Biovision | 50 µg | 419 EUR |
Coronavirus (SARS-CoV-2) PCR Detection Kit |
|||
K1460 | Biovision | 100 Rxns | 570 EUR |
Coronavirus (SARS-CoV-2) PCR Detection Kit |
|||
K1460-100 | Biovision | 100 Rxns | 551 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 Nucleoprotein (1-430) |
|||
P1537-10 | Biovision | 10 µg | 156 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 Nucleoprotein (1-430) |
|||
P1537-50 | Biovision | 50 µg | 530 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 Nucleoprotein (1-430) |
|||
P1539-10 | Biovision | 10 µg | 156 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 Nucleoprotein (1-430) |
|||
P1539-50 | Biovision | 50 µg | 530 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 3C-like Proteinase |
|||
P1550-10 | Biovision | 10 μg | 156 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 3C-like Proteinase |
|||
P1550-50 | Biovision | 50 μg | 551 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 Papain-like Protease |
|||
P1551-10 | Biovision | 10 μg | 156 EUR |
Recombinant SARS-CoV-2 Papain-like Protease |
|||
P1551-50 | Biovision | 50 μg | 551 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike Antibody |
|||
3525-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike Antibody |
|||
3525-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) Envelope Antibody |
|||
3531-002mg | ProSci | 0.02 mg | 171.82 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) Envelope Antibody |
|||
3531-01mg | ProSci | 0.1 mg | 436.42 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) NSP7 Peptide |
|||
9155P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) Membrane Peptide |
|||
9157P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) NSP8 Peptide |
|||
9159P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
SARS-CoV-2 (COVID-19) NSP9 Peptide |
|||
9161P | ProSci | 0.05 mg | 196.25 EUR |
falciparum – tylko infekcje mikroskopowe, ale infekcje mieszane P. falciparum przez LDR-FMA również wykazywały podobne wyniki przy dodatnim wyniku prążka RDT. Ponadto, aby potwierdzić tę obserwację, użyliśmy różnych parazytemii (3-0,0001%) utrzymywanego w laboratorium szczepu 3D7. Dodatni prążek pLDH u osobników z wysokim zakażeniem P. falciparum może skomplikować diagnostykę i leczenie, szczególnie gdy mikroskopia nie pozwala na stwierdzenie P. vivax , a te dwie infekcje wymagają różnych metod leczenia.